Cette analyse consiste à prélever un échantillon de surface à l'aide d'un frottis ou d'un écouvillon. Les échantillons sont ensuite cultivés sur des milieux spécifiques qui favorisent la croissance des moisissures du genre TL (Trichoderma, Aspergillus, Penicillium). Les colonies de moisissures sont ensuite dénombrées et identifiées au niveau du genre.